Sau khi Cục thuế Tp. HCM ban hành Công văn số 6969/CT-TTHT ngày 03/9/2009 V/v thuế TNCN chuyển nhượng bất động sản, trong đó xác định thu nhập từ việc chuyển quyền thực hiện các hợp đồng góp vốn, hợp tác đầu tư để nhận quyền mua căn hộ, nền nhà thì đều phải nộp thuế thu nhập cá nhân áp dụng đối với trường hợp chuyển nhượng bất động sản. Văn bản trên đã gây ra nhiều phản ứng khác nhau khi cơ quan thuế chỉ chấp nhận trừ các chi phí liên quan trực tiếp đến việc chuyển nhượng (nếu có phát sinh và có hóa đơn, chứng từ hợp pháp) trước khi tính thuế thu nhập cá nhân, còn nhiều khoản chi phí khác như lãi vay ngân hàng (…) lại không được trừ để tính thuế thu nhập cá nhân. Tuy nhiên, theo dự thảo Công văn của Tổng Cục thuế về thuế thu nhập cá nhân đối với hoạt động chuyển nhượng bất động sản thì các khoản chi phí hợp lý được trừ trước khi tính thuế thu nhập cá nhân từ chuyển nhượng bất động sản được xác định như sau:

● Đối với những người có hợp đồng vay ngân hàng để mua căn hộ, mua nền nhà, thực tế dùng tiền vay để góp vốn hoặc nộp tiền mua nhà; có chứng từ trả lãi tiền vay phù hợp với hợp đồng thì khi xác định thu nhập chịu thuế, khoản trả lãi tiền vay cũng được xác định là chi phí hợp lý.

● Đối với trường hợp mới chỉ góp vốn một phần vốn (chưa nộp đủ số tiền theo hợp đồng) thì thu nhập chịu thuế được xác định như sau:

Thu nhập chịu thuế TNCN = Giá chuyển nhượng – Giá vốn của hợp đồng chuyển nhượng – Các chi phí hợp lý.

Trong đó:

Giá vốn của hợp đồng chuyển nhượng = Tổng số vốn phải góp theo hợp đồng – Phần vốn góp còn thiếu (chưa nộp)